معلومة

لماذا تؤثر مصفوفة النقاط على قيمة E (بلاست)

لماذا تؤثر مصفوفة النقاط على قيمة E (بلاست)


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

عندما أقوم بمحاذاة تسلسلين من بروتين HBB لهما هوية 80 ٪ ، استخدمت نوعين من مصفوفات النتائج: Blosum62 و PAM30 ، لمعرفة التأثير على نتائجي.

لقد لاحظت أن درجة البت أعلى عندما استخدمت PAM30 بدلاً من BLOSUM62 ، وهو أمر منطقي لأن PAM30 يعتمد على الأنواع الأكثر ارتباطًا.

ومع ذلك ، لا أفهم سبب اختلاف القيم الإلكترونية عن بعضها البعض:

PAMP62: درجة البت: 251 ، قيمة E: 8 * 10 ^ 91

PAM30: درجة البت: 258 ، قيمة E: 6 * 10 ^ 82

سؤال: لا أفهم لماذا تتغير القيمة الإلكترونية عند استخدام مصفوفة تسجيل أخرى؟

اشكرك،


ربما يكون هذا البرنامج التعليمي لـ BLAST بواسطة Steve Altschul مفيدًا: إحصائيات درجات تشابه التسلسل

يوجد أيضًا كتاب بلاست من تأليف مارك ياندل وإيان كورف.


شاهد الفيديو: ضرب المصفوفات 1 - شرح مبسط وسهل - matrix production (شهر نوفمبر 2022).